Goede compost is vrij van onkruidzaden en ziektekiemen. In het kader van het Interreg project Soilcom maakte Vlaco vzw een overzicht van de verschillende hygiënisatievereisten die nodig zijn.
Boomkwekers, siertelers, land- en tuinbouwers vragen zich dikwijls af of ze met compost geen ziektekiemen of onkruidzaden zullen verspreiden. Heel begrijpelijk want bestrijding van onkruid of een ziekte op de planten kan handenvol geld kosten.